Polimorfizm miejsca wiązania Sp1 COL1A1 predysponuje do złamania osteoporotycznego przez wpływ na gęstość i jakość kości ad 5

Aby ocenić, czy specyficzne dla genotypu zmniejszenie BMD i BMI było wystarczające, aby wyjaśnić wzrost ryzyka złamania związanego z polimorfizmem COL1A1, porównaliśmy rzeczywisty wzrost ryzyka złamania w paskach. i. ss. grupy genotypów, które zostałyby przewidziane na podstawie różnic w BMD i BMI. Obliczenia wykonano dla BMD kręgosłupa w przewidywaniu złamań kręgów, jako że były one zdecydowanie najczęstszymi złamaniami reprezentowanymi w metaanalizie. Wcześniejsza praca wykazała, że iloraz szans urazu kręgosłupa wynosi 2,02 dla każdej redukcji SD w BMD kręgosłupa, co stanowi wzrost ryzyka o 102% na SD (26) i 1,38 dla każdej redukcji BMI (27), co stanowi wzrost o 38% na SD. Tabela pokazuje, że przewidywany wzrost ryzyka złamań kręgów związanych ze zmniejszeniem BMD i BMI wahał się od 19% w porównaniu z PS. genotyp do 26% z. ss. genotyp. Przewidywany wzrost ryzyka złamania związany z tą różnicą w BMD i BMI był niewystarczający, aby wyjaśnić obserwowany wzrost ryzyka złamań związanych z allelami COL1A1, jak u pacjentów z APS. genotyp miał częstość występowania złamań kręgów o 62% w porównaniu z. SS. tematy i osoby z. ss. genotyp miał wzrost o 93%. Figura Analiza meta polimorfizmów COL1A1 w odniesieniu do BMD i złamań osteoporotycznych. (a) Standaryzowana średnia różnica (SMD) i 95% przedziały ufności między. SS. i. Ss. grupy genotypowe dla gęstości kości lędźwiowej kręgosłupa (LS BMD). (b) Odpowiednie dane dla. SS. versus. ss. porównanie genotypów. Pokazano również liczbę badanych osobników, średnią i wartości BMD SD w każdej grupie genotypowej oraz przedziały wagowe i przedziały ufności dla poszczególnych badań. Wyniki testów heterogeniczności i testy dla ogólnego efektu są pokazane w lewym dolnym rogu każdego panelu. Należy zauważyć, że dane z obu populacji badanych przez Granta i wsp. (3) pokazane są osobno jako Grant 1996a i Grant 1996b. (c) Ilości szans na złamanie dla SS. kontra. Ss. porównanie genotypów. (d) Odpowiednie dane dla. SS. versus. ss. porównanie. Liczby w kolumnach przypadków i kontroli odnoszą się do liczby osobników z genotypem ryzyka (ASs lub Ass.) W stosunku do całkowitej liczby badanych osobników. W badaniu Uitterlinden i in. (8) dostępne były dane dotyczące zarówno złamań kręgosłupa, jak i nie-kręgu, które przedstawiono odpowiednio jako Uitterlinden 1998a i Uitterlinden 1998b. Tabela Przewidywane i rzeczywiste ryzyko złamania w odniesieniu do genotypu COL1A1 i innych zmiennych A Wpływ polimorfizmu Sp1 na powinowactwo wiązania DNA z białkiem. Powinowactwo wiązania białka Sp1 do miejsca rozpoznawania polimorficznego DNA w COL1A1 analizowano za pomocą testów zmiany żelowej (Figura 2). Nieopisane. zawodnik związany Sp1 z większym powinowactwem niż nieopisane. S. konkurenta, o czym świadczy obniżona intensywność znakowanego radioaktywnie kompleksu Sp1-DNA w równoważnych stężeniach konkurenta. Stężenia, przy których wystąpiło 50% zahamowanie intensywności pasma (pIC50) były istotnie różne dla P. (pIC50 = 0,095. M) i. s. (pIC50 = 0,039 P, M) oligonukleotydy (P <0,001). Podobne różnice w powinowactwie wiązania z białkiem stwierdzono w przypadku znakowanych radioaktywnie. allel był używany jako sonda zamiast. S. allel i gdy ekstrakty białka jądrowego pochodzące z komórek MG63 osteoblastopodobnych zastosowano w miejsce hrSpl (dane nie pokazane). Figura 2 (a) Typowy test przesunięcia żelu z S-znakowanym 32P. oligonukleotyd i białko hrSp1 (wszystkie ścieżki), ilustrujące kompleks DNA-Sp1 (przesunięcie) i supershiftowany kompleks (supershift) wytworzony przez inkubację hrSp1 z przeciwciałem Sp1 (linia 2). Zmiana jest szybciej tłumiona wraz ze wzrostem stężenia nieoznakowanych. oligonukleotyd (ścieżki 8. 12) w porównaniu z nieznakowanym. S. oligonukleotyd (ścieżki 3. 7). (b) Analiza powinowactwa wiązania Sp1. Intensywność pasma przesunięcia w ścieżkach zawierających oligonukleotydy konkurentów wyrażono jako procent intensywności pasma przy braku konkurenta (kontrola, ścieżka 1) i analizowano za pomocą GraphPad Prism. Punkty danych to środki. SEM z trzech eksperymentów. Obfitość specyficznych dla allelu transkryptów w heterozygotach. Aby zbadać, czy różnice obserwowane w testach wiązania DNA z białkiem były powiązane ze zmianami w transkrypcji COL1A1, badaliśmy obfitość transkryptu w psi. heterozygot za pomocą polimorficznego miejsca Sp1 do wykrywania transkryptów swoistych dla allelu w nie sklasyfikowanym RNA za pomocą pół-zagnieżdżonego testu RFLP-PCR (Figura 3a). Obfitość produktu pochodzącego z. S. allel był znacznie większy niż ten pochodzący z P. produkt pochodny allelu A dla dziesięciu heterozygotycznych pacjentów, u których był badany (reprezentatywny elektroforogram, rysunek 3b, środkowy) [podobne: królestwo pierożka, najtańsze apteki internetowe, cukiernia michalscy ] [hasła pokrewne: studio urody 11, vanilla komis, cukiernia michalscy ]