Identyfikacja onkogenów fuzji kinaz w raku tarczycy wywołanym promieniowaniem popromiennym

Narażenie na promieniowanie jonizujące w dzieciństwie znacznie zwiększa ryzyko rozwoju raka brodawkowatego tarczycy. Przebadaliśmy tkanki od 26 ukraińskich pacjentów z rakiem tarczycy, którzy byli młodsi niż 10 lat i żyli na skażonych terenach w czasie awarii reaktora jądrowego w Czarnobylu. Zidentyfikowaliśmy nienasążające mutacje somatycznych kierowców we wszystkich 26 przypadkach poprzez testy genów kandydujących i sekwencjonowanie RNA następnej generacji. Stwierdziliśmy, że 22 nowotwory zawierały onkogeny fuzyjne, powstałe głównie w wyniku przegrupowań wewnątrz chromosomów. Łącznie 23 z onkogennych kierowców zidentyfikowanych w tej kohorcie nieprawidłowo aktywuje przekazywanie sygnałów przez MAPK, w tym 2 przegrupowania somatyczne powodujące fuzję czynnika transkrypcyjnego ETS wariant 6 (ETV6) z neurotroficznym receptorem kinazy tyrozynowej, typ 3 (NTRK3) i fuzję kinazy acyloglicerolowej ( AGK) z BRAF. Dwa inne guzy zawierały różne fuzje prowadzące do nadekspresji jądrowego receptora PPAR .. W przypadku nowotworów pochodzących z kohorty dzieci z rakiem tarczycy u dzieci, które nie były eksponowane na promieniowanie, ale pochodził z tych samych regionów geograficznych, onkogeny fuzyjne były mniej powszechne. Nowotwory tarczycy wywołane promieniowaniem stanowią paradygmat nowotworzenia powodowany przez onkogeny fuzyjne, które aktywują przekazywanie sygnału przez MAPK lub, rzadziej, program transkrypcyjny z PPARy. Wprowadzenie Istnieją silne dowody epidemiologiczne, że promieniowanie jonizujące jest wyzwalającym wydarzeniem prowadzącym do rozwoju brodawkowatych raków tarczycy (PTC) u dzieci, które zostały narażone na opadanie po awarii reaktora jądrowego w Czarnobylu (1, 2). Raki tarczycy powstające u tych narażonych dzieci wykazują wysoką częstość rearanżacji RET / PTC, co prowadzi do konstytutywnej ekspresji i aktywacji domeny kinazy receptora kinazy tyrozynowej RET (3-6). Związek pomiędzy ekspozycją na promieniowanie a generowaniem zdarzeń rekombinacji jest prawdopodobnie bezpośredni i przyczynowy. Tak więc, transkrypty fuzyjne RET / PTC są generowane przez promieniowanie jonizujące w ludzkich liniach komórek tarczycy i ksenoprzeszczepach ludzkich tkanek płodowych tarczycy (7, 8). Locki genów biorące udział w tych zdarzeniach fuzji leżą blisko siebie w bliskości przestrzennej w obrębie ludzkiego jądra tarczycy podczas interfazy i prawdopodobnie są predysponowane do rekombinacji sąsiednich regionów chromosomowych po wywołanym promieniowaniem uszkodzeniu DNA (9, 10). Rola promieniowania w generowaniu onkogenów fuzyjnych w komórkach tarczycy skłoniła nas do przebadania dużej liczby próbek raka po awarii w Czarnobylu w celu zidentyfikowania jeszcze nieodkrytych translokacji kierowców w tej chorobie. Udało nam się zidentyfikować zdarzenia kierowców w każdym przypadku, w tym nowe fuzje, które przewidują alternatywne mechanizmy transformacji komórek tarczycy. Wyniki Przeszukiwanie pod kątem znanych zdarzeń genetycznych w raku tarczycy u dzieci narażonych na promieniowanie ujawnia wysoką częstość występowania onkogenów fuzyjnych. Otrzymaliśmy próbki tkanek od 26 ukraińskich pacjentów, którzy mieli mniej niż 10 lat i żyli na skażonych terenach w czasie awarii w Czarnobylu, aby zidentyfikować prawdopodobne somatyczne onkogenne czynniki chorobotwórcze tej choroby (Tabela uzupełniająca 1, materiał uzupełniający dostępny online w tym artykule; : 10,1172 / JCI69766DS1). Najpierw przeszukaliśmy je pod kątem znanych zdarzeń onkogennych (4, 11. 13) i odkryliśmy mutacje kierowców w guzach 21 z 26 pacjentów: 18 z 26 (69%) pacjentów miało rearanżacje (15 RET / PTC [w tym 6 RET / PTC3 , 4 RET / PTC1, 2 RET / PTC6, RET / PTC-3, RET / PTC9 i RET / PTC z nieznanym partnerem], TPR-NTRK1 [TRK-T2], PAX8-PPARG, i AKAP9-BRAF) i 3 z 26 (12%) pacjentów miało punktowe mutacje / indele (2 BRAFV600E i BRAFV600_K601> E) (Figura 1). Pięć nowotworów tarczycy narażonych na promieniowanie nie miało żadnych znanych zmian kierowców zidentyfikowanych przez to kandydujące podejście genowe, a zatem wybrano je do sekwencjonowania RNA sparowanego końca (RNA-seq). Ryc. 1Sekranowe zmiany genetyczne w raku tarczycy u dzieci. (A) Analiza niezrównoważonej ekspresji RET (eksonów 10 i 11 / eksonów 12 i 13) w celu wykrycia próbek z onkogenami fuzji RET. Na rysunku przedstawiono reprezentatywne wykresy CT z ilościowego RT-PCR eksonów 10 i 11 (kodującego domenę zewnątrzkomórkową) oraz 12 i 13 (kodującego domenę cytoplazmatyczną) próbki bez onkogenu fuzji RET (stosunek ~ 1: 1) (po lewej) i próbki z fuzją RET (po prawej). (B) Sekwencjonowanie RT-PCR i Sanger do identyfikacji i walidacji onkogenów fuzji TPR-NTRK1 i AKAP9-BRAF w 2 nowotworach eksponowanych na promieniowanie. (C) Podsumowanie zmian genetycznych stwierdzonych w 26 raków tarczycy narażonych na promieniowanie. Wszyscy z wyjątkiem 5 mieli jedno z wcześniej opisanych zdarzeń onkogennych. 5 nowotworów bez możliwego do zidentyfikowania defektu na ekranie z genem kandydata przeszło RNA-seq. Wykrywanie nowych onkogenów fuzyjnych w raku tarczycy u dzieci narażonych na promieniowanie przez RNA-seq
[przypisy: maseczka na włosy z siemienia lnianego, fishing24, najtańsze apteki internetowe ]
[patrz też: bałkanica kraków, no game kraków, u romana kraków ]